Editar menus

Si quieres editar las plantillas, la navegación se encuentra en la plantilla navbar, me parece que para ambos se encuentra ahí.
Si quieres agregar pestañas arriba para enlazar a otras páginas puedes usar este addon
vBH - Agregar Nuevas Pestañas 1.0

Para agregar más links en la barra inferior, existe una modifiación en vBulletin.org que te deja agregar los que quieras:
Dynamic Navbarlinks - vBulletin.org Forum

Para los test al registrarse, supongo que te refieres a esos donde el usuario tiene que responder a una pregunta y si la responde bien pasa al formulario de registro.
Puedes hacer eso yendo a Opciones de Verificación Humana esa opción está en el recuadro de Opciones de vBulletin.
Una vez ahí, elijes Verificación de pregunta y respuesta y le das a guardar. Luego vas a ver opciones para poder agregar preguntas y agregar la respuesta que el usuario debe ingresar para poder pasar.

No puedes añadir campos de la forma que dices, solo podrías crear dos campos iguales, uno para que elijan su país y otro para que elijan su comunidad.

No hay opciones para guardar contraseñas sin encriptar, ni van a existir. Para que quieres guardar las contraseñas sin encriptar? Si realmente quieres hacerlo, creo que tendrías que modificar muchos archivos del foro.

Sobre los addons/hacks que debas instalar en realidad depende de las funciones extras que tu quieres añadir a tu foro, así que es cuestión de gustos. Para darte una idea mejor de que podrías instalar, visita aquí para addons de vBulletin 4:
vBulletin 4.0 Modifications - vBulletin.org Forum

Y aquí para vB3.4.8
vBulletin 3.8 Modifications - vBulletin.org Forum

Solo revisa los títulos y si te interesa algo entras a su tema y vas leyendo de que trata, así sabrás que puede interesarte a ti en particular.

Por ultimo una duda que me corroe bastante

Estoy esperando a que salga la versión 4, pero la verdad yo simplemente cuando lo adquiri ya estaba la 3.8.2 y ya me llamaba la atención lo suficiente, ahora bien mi pregunta es....

¿Si instalo una 3.8.4 sera facil portarlo a la versión 4? ¿La estructura del template es la misma? o a sufrido un cambio tan considerable que sería realizar el trabajo dos veces, y por ultimo basandose en experiencias pasadas ¿Los hacks son migrables entre versiones? o simplemente mueren hasta que alguien hace una nueva versión y quizas no interesa pasar a la versión 4 hasta que todos estos han sido "remasterizados".



A con respecto al porque quiero guardar la pass sin encriptar, de hecho tiene varias explicaciones, pero una de ellas es que quiero recoger esa pass y que al registrarse en el foro se registre automaticamente en el resto de aplicaciones de mi comunidad y no que tengan que andar registrandose en cada una de las secciones, no es algo primordial y es algo que tampoco haría si afectase a la integridad y seguridad del foro, pero que si me interesa almenos plantearlo por si alguno ya tenia la experiencia.

Att DarkTerror

Si instalas 3.8.4, vas a poder actualizar a 4.0 pero no van a servir tus addons de 3.4.8 ni tus estilos. Todo se hace incompatible con vB4. Si vas empezando tu comunidad, creo que es mejor que no instales addons por ahora y esperes a que vB4 llegue a ser estable para entonces actualizar y empezar a crear tu estilo e instalar addons.

Sobre la contraseña, siempre hay maneras de poder integrar páginas que no son parte de vBulletin, aún estando encriptada las contraseñas. Para vb3.8 habían varios addons que hacían eso, pero para vB4 creo que aún no hay.